Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHAF1AQ13111 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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