Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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