Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPN13Q12923 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPN13Q12923 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPN13Q12923 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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PTPN13Q12923 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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PTPN13Q12923 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPN13Q12923 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
PTPN13Q12923 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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