Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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BPTFQ12830 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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BPTFQ12830 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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BPTFQ12830 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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BPTFQ12830 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BPTFQ12830 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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