Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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