Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC88CQ9P219 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms