Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
USF2Q15853 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USF2Q15853 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms