Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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VAMP3Q15836 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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VAMP3Q15836 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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VAMP3Q15836 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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VAMP3Q15836 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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