Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SS18Q15532 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SS18Q15532 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms