Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms