Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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