Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GPS1Q13098 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GPS1Q13098 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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