Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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