Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TMPOP42166 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TMPOP42166 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TMPOP42166 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TMPOP42166 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TMPOP42166 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TMPOP42166 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms