Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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FOXQ1Q9C009 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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FOXQ1Q9C009 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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FOXQ1Q9C009 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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FOXQ1Q9C009 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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FOXQ1Q9C009 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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FOXQ1Q9C009 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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FOXQ1Q9C009 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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