Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms