Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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FOXE3Q13461 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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