Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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