Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms