Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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