Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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