Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SEC23BQ15437 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEC23BQ15437 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEC23BQ15437 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SEC23BQ15437 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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