Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXE3Q13461 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms