Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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