Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms