Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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CNTN1Q12860 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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CNTN1Q12860 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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CNTN1Q12860 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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CNTN1Q12860 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNTN1Q12860 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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