Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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FOXO1Q12778 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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FOXO1Q12778 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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FOXO1Q12778 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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FOXO1Q12778 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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FOXO1Q12778 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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