Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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