Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HLA-DQB1P01920 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HLA-DQB1P01920 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HLA-DQB1P01920 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HLA-DQB1P01920 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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