Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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