Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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