Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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