Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
COL24A1Q17RW2 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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COL24A1Q17RW2 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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COL24A1Q17RW2 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
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COL24A1Q17RW2 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL24A1Q17RW2 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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