Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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