Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SS18Q15532 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms