Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms