Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms