Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NME3Q13232 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms