Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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