Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
MTSS1O43312 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms