Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC96Q2M329 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms