Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NRF1Q16656 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms