Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
USF2Q15853 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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