Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms