Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms