Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
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COL19A1Q14993 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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COL19A1Q14993 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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COL19A1Q14993 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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COL19A1Q14993 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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COL19A1Q14993 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL19A1Q14993 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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