Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL4A6Q14031 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms