Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms