Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
CLN3Q13286 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms