Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DUSP4Q13115 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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